Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 R3HDM2P1-201ENST00000505381 1960 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CALCOCO2-215ENST00000509507 1512 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 C1orf158-203ENST00000614859 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC006457.1-201ENST00000420733 392 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 LINC00851-201ENST00000423033 727 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ARL2BPP7-201ENST00000446421 490 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL161937.1-202ENST00000451960 341 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC021001.1-201ENST00000518703 987 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC243972.1-201ENST00000542992 570 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC010323.2-201ENST00000596405 594 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 FAM205BP-202ENST00000399773 4009 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CPA6-201ENST00000297770 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC117382.2-201ENST00000564748 3151 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 DNAH10-209ENST00000614082 3484 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC5B-201ENST00000276570 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CD200-203ENST00000473539 1524 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 EPN2-204ENST00000395620 3860 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CORIN-205ENST00000504584 2417 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 DNMBP-204ENST00000636706 5437 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC006450.2-201ENST00000429482 581 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 NUTF2P4-201ENST00000458353 381 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC068134.3-201ENST00000513620 788 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC007495.1-202ENST00000565155 559 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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