Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 FER1L5-205ENST00000623246 6513 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NWD1-205ENST00000549814 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 C1QTNF7-204ENST00000429690 4464 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RASSF2-202ENST00000379400 5427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PCYT1B-203ENST00000379145 5307 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LAMA3-203ENST00000399516 9834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ANO5-201ENST00000324559 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR8J1-201ENST00000303039 1074 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KIZ-AS1-203ENST00000616177 5370 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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