Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGA7Q13683 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGA7Q13683 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms