Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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