Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AGXT2-206ENST00000618015 2181 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTA1P02549 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 AC139795.3-201ENST00000606358 541 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTA1P02549 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms