Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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