Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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