Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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FAM3AP98173 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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FAM3AP98173 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FAM3AP98173 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FAM3AP98173 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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