Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms