Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTPRMP28827 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTPRMP28827 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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PTPRMP28827 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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PTPRMP28827 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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PTPRMP28827 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 FAM26E-201ENST00000368599 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRMP28827 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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