Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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HOXD10P28358 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL513548.2-201ENST00000602994 1207 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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