Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
B4DXG7 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
B4DXG7 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
B4DXG7 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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