Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 PDE4DIP-208ENST00000464103 1055 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
USP35Q9P2H5 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms