Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CD40LG-201ENST00000370628 1720 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MOSPD2-204ENST00000482354 1870 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ZNF252P-208ENST00000592792 2485 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 SUGT1P3-201ENST00000304932 1051 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LEMD1-201ENST00000367149 604 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 IGLV11-55-201ENST00000390286 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC004830.1-201ENST00000420449 285 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC007683.1-201ENST00000432746 591 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC092569.1-201ENST00000455192 258 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CHIAP1-201ENST00000456220 995 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC098679.2-201ENST00000513067 365 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 IGHVII-30-1-201ENST00000522218 301 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC018653.2-201ENST00000540190 238 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 BNIP3P15-201ENST00000604600 301 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CALCR-205ENST00000421592 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 PALM2-AKAP2-202ENST00000374530 7507 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CCDC190-203ENST00000367912 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC00484-205ENST00000423719 3023 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ZSCAN23-201ENST00000289788 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CPNE4-210ENST00000512332 2230 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 DARS2-201ENST00000361951 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 KCNMA1-214ENST00000434208 4055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
C4orf17Q53FE4 AL008721.2-201ENST00000609475 3754 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms