Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms