Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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