Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CTXN3Q4LDR2 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms