Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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