Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 COL4A6-203ENST00000394872 6750 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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