Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SCN4AP35499 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SCN4AP35499 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SCN4AP35499 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SCN4AP35499 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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