Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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