Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms