Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.5 ms