Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms