Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A5P29400 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A5P29400 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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