Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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