Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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HTR4Q13639 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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HTR4Q13639 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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HTR4Q13639 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HTR4Q13639 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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