Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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