Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 FAT3-206ENST00000533797 7894 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RNF152-201ENST00000312828 9501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 MYOM1-203ENST00000400569 4927 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ZNF471-201ENST00000308031 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms