Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 RNF152-201ENST00000312828 9501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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TCOF1Q13428 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TCOF1Q13428 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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