Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AC022167.2-201ENST00000565934 2288 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 HERC3-202ENST00000402738 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NECAP1P1-201ENST00000320802 830 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SIRPG-203ENST00000344103 1042 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL024509.1-201ENST00000397093 927 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC073091.1-201ENST00000398059 864 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL356108.1-201ENST00000416510 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LINC00426-202ENST00000417079 1045 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL117328.1-201ENST00000422315 162 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RHOA-203ENST00000422781 961 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC006195.1-201ENST00000423599 923 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 Z74696.1-201ENST00000428208 1123 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL008638.1-201ENST00000430468 473 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RPS10P7-202ENST00000482594 494 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SYNPR-AS1-201ENST00000488201 558 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CUTA-211ENST00000488478 676 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 C6orf52-206ENST00000503680 682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NANOGP1-201ENST00000525030 915 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 WARSP1-201ENST00000533936 454 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LINC01588-209ENST00000556019 534 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NFATC4-233ENST00000557767 856 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 IGHV1OR16-4-201ENST00000566350 205 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 VN1R67P-201ENST00000568379 913 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL693P-201ENST00000579576 279 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF763-205ENST00000592625 582 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL359198.1-201ENST00000610263 571 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 OR9Q1-202ENST00000612174 2134 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TTC28-AS1_4.1-201ENST00000619378 112 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 GLOD4-218ENST00000625892 111 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 GLOD4-219ENST00000628529 111 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TMCO1-209ENST00000628579 477 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RHOBTB2-205ENST00000519685 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLFN5-202ENST00000542451 2540 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MAGEB16-201ENST00000399985 1667 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DEPDC5-204ENST00000400246 5551 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF829-203ENST00000520965 4977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL139220.2-207ENST00000434244 2644 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZFP57-201ENST00000376881 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 GOSR2-213ENST00000638216 3574 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NLRX1-203ENST00000409265 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PDPN-202ENST00000376057 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DEPDC5-202ENST00000382112 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 C8B-205ENST00000535057 2289 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC005697.2-201ENST00000581901 2266 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SEMA4D-202ENST00000356444 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MRVI1-217ENST00000558540 3339 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 THRB-201ENST00000280696 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC026333.3-201ENST00000543611 1731 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CYP4F9P-201ENST00000589847 1339 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC091167.8-201ENST00000641199 3441 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ITGB6-211ENST00000620391 4401 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC009779.3-202ENST00000550412 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZP2-203ENST00000574002 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 IPO9-AS1-202ENST00000421159 456 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DDX11L5-201ENST00000421620 654 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 FARP1-AS1-201ENST00000432229 323 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms