Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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