Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
DSG1Q02413 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms