Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
VAX2Q9UIW0 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
VAX2Q9UIW0 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
VAX2Q9UIW0 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
VAX2Q9UIW0 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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VAX2Q9UIW0 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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VAX2Q9UIW0 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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