Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CNPY1-201ENST00000321736 2378 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DMBT1-207ENST00000619379 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CNTNAP4-201ENST00000307431 4867 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CNTNAP4-207ENST00000611870 4867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AP004147.1-201ENST00000505153 6314 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PABPC4L-201ENST00000421491 4944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GRIK2-202ENST00000358361 1981 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GABRB3-204ENST00000541819 5934 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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