Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 TRERF1-204ENST00000372922 7286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 CSNK1G1-211ENST00000635142 5548 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 MEIS2-211ENST00000559085 2538 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 OR2G6-201ENST00000343414 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 C4orf51-201ENST00000438731 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AP001973.1-201ENST00000530177 572 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 LINC00520-202ENST00000554196 514 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 LINC01588-211ENST00000556434 892 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC239859.1-201ENST00000449715 2594 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 COL6A4P1-201ENST00000446690 2336 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 GALNT8-201ENST00000252318 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC064805.1-202ENST00000569279 3493 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 DIS3L2-201ENST00000273009 3201 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 ABCC11-202ENST00000356608 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC110079.1-201ENST00000567913 4395 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC068790.9-201ENST00000621669 2838 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRHP20396 SEC16B-201ENST00000308284 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 PPARG-207ENST00000397015 1722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL445531.1-201ENST00000562653 1728 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 CYTH4-201ENST00000248901 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 TMEM52B-201ENST00000298530 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 MYH2-202ENST00000397183 6078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 ZNF333-201ENST00000292530 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 MRPL19-202ENST00000393909 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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TRHP20396 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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TRHP20396 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL135924.2-201ENST00000427901 361 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 LINC01007-203ENST00000451953 579 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC106028.1-201ENST00000554322 526 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC090415.1-201ENST00000581877 847 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 AP001017.1-201ENST00000591378 482 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 PPP3R2-202ENST00000636434 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 ABLIM1-201ENST00000277895 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 ADGRG1-255ENST00000567835 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 LINC01600-201ENST00000624527 2434 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRHP20396 TMC3-202ENST00000558726 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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