Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN16Q9Y5I7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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