Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXBP1Q9Y5B6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms