Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
R3HCC1Q9Y3T6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms