Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms