Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1DQ9Y2S0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms