Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC5Q9UQL6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
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