Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE2

RPH3AL, Rab effector Noc2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3ALQ9UNE2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPH3ALQ9UNE2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPH3ALQ9UNE2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPH3ALQ9UNE2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPH3ALQ9UNE2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPH3ALQ9UNE2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPH3ALQ9UNE2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPH3ALQ9UNE2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPH3ALQ9UNE2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPH3ALQ9UNE2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPH3ALQ9UNE2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3ALQ9UNE2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms