Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA4Q9UN74 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA4Q9UN74 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms