Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms