Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms