Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHIC2Q9UKJ5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHIC2Q9UKJ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHIC2Q9UKJ5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms