Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms