Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS51Q9UID3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS51Q9UID3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS51Q9UID3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms