Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX20Q9UHI6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX20Q9UHI6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms